imbg


Неофициальный сайт Института молекулярной биологии и генетики НАНУ


Previous Entry Add to Memories Share Next Entry
Невероятно но факт
imbg
Иногда за чаем с плюшками охота поразить коллег своей энциклопедичностью, мимоходом сказав нечто эдакое, чего не найдешь в Википедии.

Недавно на лекции услышал интересный факт - два цитокина, интерлейкин 34 (IL-34) и CSF-1 (Macrophage colony-stimulating factor 1) не имеют никакой абсолютно гомологии по аминокислотной последовательности (align). Тем не менее, их трехмерная структура очень похожа (лектор говорил - almost 100% homology, но я сам посмотрел картинки и прям такой уж 100% гомологии все-таки не  нашел,поэтому воздержусь).


Crystal Structure of Human Interleukin-34 Bound to Human CSF-1R

Их 3D структуры до того схожи, что IL-34 с готовностью узнается рецептором CSF-1 (pdb и на картинке). Таковы парадоксы природы!

Nota bene: IL-34 нужен  для дифференциации микроглии мозга, она же - макрофаги мозга.

promo Buy for 20 tokens
О свободе слова в России philologist
Вчера вечером основатель и генеральный директор социальной сети Вконтакте Павел Дуров оставил на свой странице следующее сообщение: "13 марта…

> IL-34 с готовностью узнается рецептором CSF-1

а наоборот?

я не нашел, но не очень искал - просто по свежей памяти после лекции записал :).

P.S. Вроде, быстрый поиск показывает что рецептора своего у IL-34 нет, он чаще всего работает как раз через рецептор фактора макроофагов (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20489731)

"Таковы парадоксы природы!"

Это эмоция. А в сухом остатке - надо отказываться от догмы, что третичная структура белка - определяется первичной?

"...однозначно определяется первичной". 2 решения иметь для 3-oй структуры никто IMHO не запрещал.

нет конечно, даже более того, наверняка и в той, и в другой последовательности должны быть заложены основы для схожих третичных структур.
Мне именно нравится то, что довольно редкое исключение поймано за хвост - сименами белков, явками, паролями ). Именно, просто чтоб где-нибудь при случае ввернуть, ничего более )

определяться то она определяется
но важнее именно третичная, поэтому первичная может плыть как угодно

Более того, гомологи можно создавать искусственно:
Dahiyat B.I and Mayo S.L. (1997) De Novo Protein Design: Fully Automated Sequence Selection

Для цитокин-рецепторов 1-ого типа промискуитивное связывание разных лигандов - не новость. Так, ЭРББ4 помимо белков семейства эпидермального фактора роста, взаимодейчствует с нейроглинами. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3390854/

You are viewing imbg